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临床应用Bionano赋能不孕不育快 [复制链接]

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北京酒渣鼻专业医院 http://m.39.net/pf/a_8733714.html

医院姚元庆团队采用Bionano单分子光学图谱技术,精确检测到9例不孕不育患者的染色体平衡易位断点信息,证明单分子光学图谱具有潜在的临床应用价值,可作为一种快速筛查工具,用于不孕不育或其他疾病的平衡易位携带者筛查。

该成果于年2月5日发表于JournalofAssistedReproductionandGenetics.

Bionano小课堂

老白

啥是平衡易位?

小撒

平衡易位是一种常见的染色体结构重排,形成原因是由两条或多条染色体发生断裂后随机拼接到一起,新生儿中的发生率约0.2%。

老白

有什么影响吗?

小撒

如果该易位断点发生在基因组中的非重复序列区域,重排的染色体可以维持正常的基因表达,因此不会有临床症状;5%的断点恰好发生在单倍剂量不足基因或其调节元件上,则会致病。男性平衡易位携带者生育力低下,而女性携带者则会反复流产。

老白

哦,后果真的很严重!

小撒

基因组的一粒灰,落在一个人头上就是一座山。

老白

Bionano单分子光学图谱检测结果对不孕不育患者有什么帮助呢?

小撒

携带平衡易位并且有不孕不育史的患者可以通过遗传咨询选择继续自然受孕或者体外人工受精(IVF,即试管婴儿),对选择体外人工受精的患者,胚胎植入前遗传学检测(PGT)能帮助患者选择植入正常的胚胎,从而孕育健康的宝宝。遗传咨询师可以建议选择Bionano来确定患者携带的易位是否对生育有影响,如果结果显示对生育有影响,患者则可以采用IVF联合PGT选择正常的胚胎。

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针对平衡易位,现有检测方法有核型分析、荧光原位杂交(FISH)和新兴的二代测序(NGS),但这几种方法都有明显的局限性。始于年代的核型分析分辨率仅3-10Mb,无法确定易位断点是否会对生育相关的重要基因产生干扰;FISH分辨率较核型更高,但是需要设计特异探针,探针设计技术要求高,实验操作难度大,结果判读也可能不明确;NGS由于读长短的缺陷很难比对出基因组重复序列间发生的易位。

姚元庆团队采用单分子光学图谱技术,在行辅助生殖的患者中探究平衡易位是否对生育相关基因产生影响。

该研究入组了9位平衡易位的携带者,7例男性,2例女性,经核型诊断他们分别携带了不同的平衡易位,其中6位男性有少精症状。这些患者经历了最长5年的不育史,其中7位患者虽最后自然受孕,但是胎儿早期流产,并且流产反复发生1-3次;另2位患者始终未能自然受孕。

结果显示,Bionano单分子光学图谱不仅检测到所有平衡易位,与临床金标准核型分析达到%一致性,更精确的给出了发生易位的两条染色体的断点位置区间,并且注释出5个受易位影响的基因FNDC3A,NUP,DPY19L1,SPPL2A,和BAI3,其中四个基因都是已报道的男性不育相关基因。

Bionano单分子光学图谱的结果是否正确呢?研究团队又采用繁琐的Mate-pairsequencing和PCR加Sangersequencing进行验证,证明Bionano单分子光学图谱的结果完全正确。更有趣的是,其中1例样本(2号患者)的断裂点正好处于高度重复区域,Mate-pairsequencing和PCR加Sangersequencing都无法测出断点,Bionano仍然给出了断点信息。

综上所述,研究团队认为单分子光学图谱具有潜在的临床应用价值,可作为一种快速筛查工具,用于不孕不育或其他疾病的平衡易位携带者筛查。在科研领域,该方法可提供染色体断点附近信息,可能会发现一些有趣的基因和新的功能。在临床应用上,针对易位等结构变异携带者,该方法可找到不孕不育的潜在病因,在产前诊断中找到变异基因,在有临床异常表型的儿童中分析结构变异以确定治疗方案。

研究团队还提出Bionano可用于其他临床应用:

1对有疾病症状但无明确病因的患者,可以采用Bionano找寻致病原因。

2产前诊断中核型检测会发现一些全新的平衡易位,但平衡易位是否致病却不清楚,Bionano可以鉴别这些易位是否打断了疾病相关基因或者影响这些基因的表达。如果该基因有显性表型,应推荐患者对妊娠进行遗传咨询。

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